В Бухгалтерии 3.0 если у вас в документе Списание с расчетного счета и других — нету вида операции Перевод на другой счет организации, то нужно выполнить следующие настройки.
Все функции — Регистры сведений — Использовать несколько банковских счетов организаций — проставить галку. При этом если у вас ведется учет по подразделениям — то Перевод на другой счет будет недоступна.
Настройка использования 57го счета в учетной политики для данного вида операции — не играет роли.